Aplicación de topología molecular a la predicción de la actividad frente a Trypanosoma brucei rhodesiense de compuestos bicíclicos derivados de la 4-metilpiperazina

  1. Bretón Martínez, José Rafael
  2. Torrico Ovando, Cinthia Delma
  3. Torrico Ovand, Nayra
  4. Gálvez Llompart, María
  5. Gálvez Álvarez, Jorge
Revista:
Nereis: revista iberoamericana interdisciplinar de métodos, modelización y simulación

ISSN: 1888-8550

Año de publicación: 2015

Número: 7

Páginas: 27-38

Tipo: Artículo

DIALNET GOOGLE SCHOLAR lock_openDialnet editor

Otras publicaciones en: Nereis: revista iberoamericana interdisciplinar de métodos, modelización y simulación

Resumen

Trypanosoma brucei rhodesiense es la causa de la forma más virulenta de la enfermedad del sueño en África del Este. Sin tratamiento esta enfermedad tiene un curso fatal. Por el momento solo hay 5 fármacos en uso y solo uno de ellos (melarsoprol) es eficaz en la fase final de la enfermedad. Se ha desarrollado un modelo topológico matemático encaminado a buscar nuevos compuestos con actividad antitripanosómica para un grupo de compuestos bicíclicos derivados de la 4-metilpiperazina. Utilizando el análisis lineal discriminante se encontró un modelo capaz de clasificar correctamente la actividad del 93% de 32 compuestos estudiados. Con el objetivo de predecir la actividad antiparasitaria, se realizó un análisis de regresión multilineal capaz de explicar el 86% de la varianza. La validación de este modelo fue realizada por el método de cross-validación y mediante un test de aleatoriedad. Finalmente, el modelo seleccionado fue aplicado para la búsqueda de nuevos compuestos bicíclicos con teórica actividad frente al Trypanosoma brucei.

Referencias bibliográficas

  • A. Taladriz, A. Healy, E. J. Flores Pérez, V. Herrero García, C. Ríos Martínez, A. A. Alkhalsi et al. Synthesis and structure-activity analysis of new phosphonium salts with potent activity against african trypanosomes, J Med Chem 55(6) (2012) 2.606-2.622.
  • V. Lutje, J. Seixas y A. Kennedy. Chemoterapy for second-stage Human African trypanosomiasis, Cochrane Database Syst Rev 8 (2010) CD006201. DOI:10.1002/14651858.CD006201.
  • B. B. Trunz, R. Jędrysiak, D. Tweats, R. Brun, M. Kaiser, J. Suwiński et al. 1-Aryl-4-nitro-1H-imidazoles, a new promising series for the treatment of human African trypanosomiasis, Eur J Med Chem 46 (2011) 1.524-1.535.
  • F. La Greca y S. Magez. Vaccination against trypanosomiasis: can it be done or is the trypanosome truly the ultimate immune destroyer and escape artist?, Hum Vaccin 7 (2011) 1.225-1.233.
  • J. Gálvez, M. Gálvez-Llompart y R. García-Doménech. Molecular topology as a novel approach for drug discovery, Expert Opin Drug Discov 7 (2012) 133-153.
  • J. Gálvez, M. Gálvez-Llompart, R. Zanni y R. García-Doménech. Molecular topology dissimilar similarities, Drug Discov Today Technol 10 (2013) e475-81.
  • M. Gálvez Llompart, M. C. Recio y R. García Doménech. Topological virtual screening: a way to find new compounds active active in ulcerative colitis by inhibiting necrosis factor -kB, Mol Divers 15(4) (2011) 917-926.
  • J. V. de Julián Ortiz, J. Gálvez, C. Muñoz-Collado, R. García Domenech y C. Gimeno Cardona. Virtual combinatorial syntheses and computational screening of new potential anti-herpes compounds, J Med Chem 42(17) (1999) 3.308-3.314
  • L. Bruno-Blanch, J. Gálvez y R. García-Domenech. Topological virtual screening: a way to find new anticonvulsant drugs from chemical diversity, Bioorg Med Chem Lett 13(16) (2003) 2.749-2.754.
  • I. Ríos-Santamarina, R. García-Domenech, J. Gálvez, J. Morcillo Esteban, P. Santamaría y J. Cortijo. Getting new bronchodilator compounds from molecular topology, Eur J Pharm Sci 22(4) (2004) 271-277.
  • J. Gálvez, R. García Domenech, M. Gómez-Lechón y J. V. Castell. Use of molecular topology in the selection of new cytostatic drugs, J Mol Theochem 504 (2000) 241-248.
  • C. de Gregorio Alapont, R. García-Doménech, J. Gálvez, M. J. Ros, S. Wolski y M. D. García. Molecular topology: a useful tool for the search of new antibacterials. Bioorg Med Chem Lett 10(17) (2000) 2033-6.
  • L. Pastor, R. García Domenech, J. Gálvez, S. Wolski y M. D. García. New antifungals selected by molecular topology, Bioorg Med Chem Lett 8(18) (1998) 2.577-2.582.
  • N. Mahmoudi, J. V. de Julian-Ortiz, L. Cicerón, J. Gálvez, D. Mazier, M. Danis et al. Identificacion of new antimalarial drugs by linear discriminant analysis and topological virtual screening, J Antimicrob Chemother 57(3) (2006) 489-497.
  • N. Mahmoudi, R. García Doménech, J. Gálvez, K. Farhati, J. F. Franetich, R. Sauerwein et al. New active drugs against liver stages of Plasmodium predicted by molecular topology, Antimicrob Agents Chemother 52 (2008) 1.215-2.
  • M. Gálvez-Llompart, R. Zanni y R. García-Doménech. Modeling natural anti-inflammatory compounds by molecular topology, Int J Mol Sci 12 (2011), 9.481-9.503.
  • M. J. Duart, R. García-Domenech, G. M. Antón-Fos y J. Gálvez. Optimization of a mathematical topological pattern for the prediction of antihistaminic activity, J Comput Aided Mol Des 15(6) (2001) 561-572.
  • M. A. Martínez Rodríguez, R. J. Seguí López-Peñalver, G. Alcácer Tomás, J. Gálvez Alvarez, M. Gálvez-Llompart y R. García-Domenech. Aplicación de la topología molecular a la predicción y optimización de la actividad repelente de mosquitos de derivados de la N-acylpiperidina, Nereis 6 (2014) 19-26.
  • T.J. Schmidt, A. M. Nour, S. A. Khalid, M. Kaiser y R. Brun. Quantitative structure-antiprotozoal activity relationships of sesquiterpene lactones, Molecules 14(6) (2009) 2.062-2.076
  • B. Guzmán Fernández, R. Zanni, M. Gálvez Llompart y R. García Doménech. Aplicación de la topología molecular en la búsqueda de nuevos compuestos derivados del 4-nitro-imidazol activos frente al Trypanosoma brucei. An Real Acad Farm 78(4) (2012) 511-526.
  • T. J. Schmidt, F. B. da Costa, N. B. Lopes, M. Kaiser y R. Brun. In silico prediction and experimental evaluation of furanoheliangolide sesquiterpene lactones as potent agents against Trypanosoma brucei rhodesiense, Antimicrob Agents Chemother 58 (2014) 325-332.
  • J. Faist, W. Seebacher, R. Saf, R. Brun, M. Kaiser y R. Weis. New N-methylpiperazinyl derivates of bicyclic antiprotozoal compounds, Eur J Med Chem 47 (2012) 510-519.
  • L. B. Kier, L.H. Hall, Molecular Connectivity in Chemistry and Drug Research, Academic Press, London (1976). [24] L. B. Kier, L. H. Hall, Molecular Connectivity in Structure-Activity Analysis. Wiley, New York (1986). [25] J. Galvez, R. García-Domenech, M. T. Salabert y R. Soler. Charge indexes. New topological Descriptors, J Chem Inf Comput Sci 34 (1994) 520-525.
  • H. J. Wiener. Structural determination of paraffin boiling points, Journal of the American Chemical Society 69(1) (1947) 17-20.
  • DESMOL11 Software. Unidad de Investigación de Diseño de Fármacos y Conectividad Molecular. Facultad de Farmacia Universitat de Valéncia, Spain.
  • R. García-Doménech, W. López-Peña, Y. Sánchez-Perdomo, J. R. Sanders, M. M. Sierra-Araujo y C. Zapata et al. Application of molecular topology to the prediction of the antimalarial activity of a group of uracil-based acyclic and deoxyuridine compounds, Int J Pharm 363(1-2) (2008) 78-84.
  • Statistica 8.0 (2008) Statsoft Inc http://www.statsoft.com.
Fuente de los datos: Dialnet