Novel Ligand-Base Approach ti Screening to Screening of Large Databases for Paramphistomicide Lead Generation

  1. Marrero Ponce, Yiovani
  2. Huesca Guillén, Alma
  3. Echevarría Díaz, Yunaymi
  4. Torrens Zaragozá, Francisco
  5. Ibarra Velarde, Froylán
Revista:
Nereis: revista iberoamericana interdisciplinar de métodos, modelización y simulación

ISSN: 1888-8550

Año de publicación: 2011

Número: 3

Páginas: 9-15

Tipo: Artículo

DIALNET GOOGLE SCHOLAR lock_openDialnet editor

Otras publicaciones en: Nereis: revista iberoamericana interdisciplinar de métodos, modelización y simulación

Resumen

En este informe se emplearon índices lineales estocásticos y no estocásticos en 2D, basados en átomos, para discriminar los compuestos de acción paramfistomicida de los inactivos. Se obtuvieron dos modelos lineales QSAR basados en la clasificación. Estas ecuaciones, llevadas a cabo teniendo en cuenta descriptores TOMOCOMD-CARDD tanto estocásticos como no estocásticos, clasifican correctamente el 88,57% de los elementos químicos de la base de datos, arrojando un buen coeficiente de correlación de Mathews del 0,77. Los modelos seleccionaron/identificaron algunos compuestos antihelmínticos y otros fármacos del índice Merck, del manual Negwer y de Goodman & Gilman como posibles paramfistomicidas, y la literatura reciente incluye a uno de ellos como poseedor de esta actividad. Los resultados demuestran la utilidad del método TOMOCOMD-CARDD para el descubrimiento de fármacos y de nuevos compuestos líderes de acción paramfistomicida.

Referencias bibliográficas

  • Anantaraman, M. Indian Vet. J. 1958, 35, 181.
  • Manna, A. K.; Pramanik, S.; Mukherjee, G. S. Indian J. Anm. Hlth. (1994), 33, 25.
  • Fairweather, I.; Boray, J. C. Vet. J. (1999), 158, 81.
  • Malviya, H. C.; Prasad, A.; Varma, T. K.; Dwivedi, P. Indian Vet. J. (1994), 71, 222.
  • Gill, J. S.; Bali, H. S. Indian Vet. Med. J. (1987), 11, 231.
  • Watson, C. Biosilico. (2003), I, 83.
  • Estrada, E.; Peña, A. Bioor. Med. Chem. (2000), 8, 2755.
  • KUBINYI, H.; TAYLOR, J.; RAMDSEN, C. (1990)In Quantitative Drug Design. Comprehensive Medicinal Chemistry; Hansch, C., Ed.; Pergamon: Oxford
  • Marrero-Ponce, Y.; Romero, V. TOMOCOMD software, Central University of Las Villas, (2002). TOMOCOMD (TOpological MOlecular COMputer Design) for Windows, version 1.0 is a preliminary experimental version; in future a professional version will be obtained upon request to Marrero: yovanimp@qf.uclv.edu.cu or ymarrero77@yahoo.es.
  • Marrero-Ponce, Y. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2010.
  • Casañola-Martín, G. M.; Khan, M. T. H.; MarreroPonce, Y.; Ather, A.; Sultankhodzhaev, M. N.; Torrens, F. Bioorg. Med. Chem. Lett. (2006), 16, 324. 12. Meneses-Marcel, A.; Marrero-Ponce, Y.; Machado-Tugores, Y.; Montero-Torres, A.; Montero Pereira, D.; Escario, J. A.; Nogal-Ruiz, J. J.; Ochoa, C.; Arán, V. J.; Martínez-Fernández, A. R.; García Sánchez, R. N. Bioorg. Med. Chem Lett. 2005, 17, 3838.
  • Marrero-Ponce Y., Medina-Marrero R., Torrens F., Martinez Y., Romero-Zaldivar V., Castro E.A. Bioorg. Med. Chem, (2005), 13, 2881.
  • Marrero-Ponce Y., Medina-Marrero R., Martinez Y., Torrens F., Romero-Zaldivar V.,
  • Castro E.A. J. Mol. Mod. (2006), 12, 255.
  • Marrero-Ponce, Y.; Iyarreta-Veitía, M.; Montero-Torres, A.; Romero-Zaldivar, C.; Brandt, C. A.; Ávila, P. E.; Kirchgatter, K. J. Chem. Inf. Model. (2005), 45, 1082.
  • Marrero-Ponce Y. Bioorg. Med. Chem. (2004), 12, 6351.
  • Marrero-Ponce Y., González-Díaz H., RomeroZaldivar V., Torrens F., Castro E.A. Bioorg. Med. Chem. (2004), 12, 5331.
  • Marrero-Ponce, Y.; Castillo-Garit, J. A.; Olazabal, E.; Serrano, H. S.; Morales, A.; Castañedo, N.; Ibarra-Velarde, F.; Huesca-Guillen, A.; Jorge, E.; del Valle, A.; Torrens, F.; Castro, E. A. J. Comput.-Aided Mol. Design. (2004), 18, 615.
  • Marrero-Ponce, Y.; Huesca-Guillen, A.; IbarraVelarde, F. J. Theor. Chem. (THEOCHEM). (2005), 717, 67.
  • Marrero-Ponce, Y.; Montero-Torres, A.; Romero-Zaldivar, C.; Iyarreta-Veitía, I.; Mayón Peréz, M.; García Sánchez, R. Bioorg. Med. Chem. (2005), 13, 1293.
  • Boray, J. C. Austr. Vet. J. (1959), 35, 282.
  • Bawa, H. S. Indian J. Vet. Sci. (1939), 9, 425.
  • Orlova, K.V. Veterinariya. (1953), 4, 20.
  • Deusov, N. L. Veterinariya. (1955), 4, 36.
  • Fedorcenko, H. G. Veterinarija. (1965), 42, 65.
  • Gill, J. S.; Bali, H. S. Indian J. Animal Res. (1987), 21, 45.
  • Bosman, C. J.; Thorold, P. W.; Purcharse, H. S. J S Afr Vet Ass. (1961), 32, 227.
  • Rolfe, P. F.; Boray, J. C. Aust Vet. J. (1987), 64, 328.
  • Probert, A. J.; Sharma, R.K.; Singh, K.; Saxena, R. J Helminthol. (1981), 55, 115.
  • Bindumadhav, A. Cheiron. (1980), 9, 258.
  • Fedorchenko, N.G. Veterinarija, (1966), 43, 39.
  • Horak, I. G. J S Afr Vet Med Ass. (1965), 36, 561.
  • Mereminskij, A.T.; Gluzman, I.Y.; Artemenko, Y.G. Veterinariya. (1968), 45, 51.
  • Nikitin, V. F.; Proshin, Y. G.; Solonimkin, V. G.; Agafonov, M. I.; Asmolov, T. A.; Meshcheryakov, A. V. Bui. Vses. Inst. GELAN (1972), 8, 45.
  • Cvetkovic, L. Veter. Glasnik. (1968), 22, 41.
  • Trifonor, T.; Dushepeeva, Y.; Meshekov, S.; Belkov. D. Veterinarna Sbirka. (1974). 71, 18.
  • Mereminskij, A. I.; Gluzman, I. Veterinarija. (1966), 6, 24.
  • Boray, J. C.; Happich, F. A.; Andrews, J. C. Vet. Res. (1967), 80, 218.
  • Boray, J C. Australian Vet. J. (1969), 45, 133.
  • Harder, A. Parasitol Res. (2002), 88, 477.
  • Rolfe, P. F.; Boray, J. C.; Aust. Vet. J. (1988), 65, 148.
  • Gevrey, J.; Bourdoiseau, G.; Le Point Veterinaire. (1998), 29, 807.
  • Sey, O.; Kassai, T. Rep. Hung. Acad. Sd. and Ministr. Food y Agric. Budapest, (1984), 12.
  • Rahman, A. Vet. Med. Rev. (1980), 1, 50.
  • Alzieu, J. P. ; Bergeaud, J. P.; Dorchies, P. Revue de Méd Vét. (1999), 150, 715.
  • Spence, S. A.; Fraser, G. C.; Chang, S. Aust. Vet. J. (1996), 74, 456.
  • Georgiev, B.; Gruev, A. Abstract Vol l. Third Nat. Conf. Parasit., Albena, Bulgaria, (1977); pp. 238-239.
  • Georgiev, B.; Gruev, A. Veterinarnomeditsinski Nauki. (1979), 16, 45.
  • Sahai, B. N.; Ansari, M. Z.; Singh, R. P.; Prasad, K. D. Indian J. Vet. Med. (1983), 3, 27.
  • Corba, J.; Pacenovsky, J.; Krupicer, I. Vet. Med. Rev. (1976), 2, 181.
  • Kobulej, T.; Uijvarhelyt, J. Acta Vet. Hung. (1972), 22, 219.
  • Chroust, I. Acta Vet. Brno. (1973), 42, 281.
  • Wikerhauser, T.; Brglez, J.; Kuticic, V. Acta Parasit. Lug. (1975), 6, 25.
  • Lammler, G.; Sahat, B. N.; Herzog, H. Acta Vet. Hung. (1969), 19, 447.
  • Madhekar, D. R.; Ramanathan, S.; Khan, M. A.; Roy, R. M. Livestock Adviser. (1987), 12, 5.
  • Gupta, R. P.; Malik, P. D.; Gautam, O. P. Trop. Anim. Health Prod. (1981), 13, 35.
  • Veerakumari, L.; Munuswamy, N. Cytobios.(1999), 98, 39.
  • Corba, J. Vet. Med. Rev. (1981), 1, 15.
  • Petkov, A.; Bankov, D.; Rusev, I.; Tomov, P. Veterinarna Sbirka. (1986), 84, 28.
  • Cankovic, M.; Imamovic, V.; Rozman, M.; Jazic, A.; Sahmanovic, S. Veterinarski Glasnik. (1988), 42, 373.
  • Visnyakov, Y.; Ivanov, V. Bull. Centr. Helminth. Lab. (1963), 8, 147
  • Gupta, R. P.; Malik, P. D.; Gautum, O. P. Indian Vet. J. (1981), 58, 246.
  • Lepojev, O.; Cvetkovic, L.; Tomanovic, B.; Grus, I. Vet. Glasnik. (1982), 36, 33.
  • Corba, J.; Stoffa, P.; Legny, J.; Krupicer, J.; Lietava, P. Veterinarstvl, (1981), 31, 118.
  • Demiaszkiewicz, A. W.; Drozdz, J.; Lachowicz, J.; Krasinski, Z. Magazyn Weterynaryjny. (1999), 8, 118.
  • Trifonov, T. Veter. Shirka. (1983), 81, 39.
  • Rolfe, P. F.; Boray, J. C. Austr. Vet. J. (1993), 70, 265.
  • Sukhapesna, V.; Tuntasuvan, D.; Suriyajantratong, W. P. Thai J. Vet. Med. (1991), 21, 165.
  • Schroder, J.; Honer, M. R.; Louw, J. P.; J S Afr Vet. Assoc. (1997), 48, 95.
  • Suh, M. D. Korean J. Vet. Res. (1983), 23, 199.
  • Martin, R. J.; Robertson, A. P.; Bjorn, H. Parasit. (1997), 114, 111.
  • Martin, R. J. The Vet. J. (1997), 11.
  • Duarta, M. J.; García-Domenech, R.; Antón-Fos, G. M. Gálvez, J. J. Comput-Aided Mol Des. (2001), 15, 561.
  • STATISTICA ver. 5.5, Statsoft, Inc. (1999).
  • Van Waterbeemd, H. Discriminant Analysis for Activity Prediction. In Chemometric Methods in Molecular Design; van Waterbeemd, H., Ed., Vol 2 VCH: Weinhiem,(1995).
  • Ford, M. G.; Salt, D.W. The Use of Canonical Correlation Analysis. In Chemometric Methods in Molecular Design; van Waterbeemd, H., Ed., Vol 2 VCH: Weinhiem,(1995).
  • Baldi, P.; Brunak, S.; Chauvin, Y.; Andersen, C. A.; Nielsen, H. Bioinformatics. (2000), 16, 412.
  • Xu, J., Hagler, A. Molecules. (2002), 7, 566.
  • Seifert, H. J. M.; Wolf, K.; Vitt, D. Biosilico. (2003), 1, 143.
  • Walters, W. P.; Stahl, M. T.; Murcko, M. A. Drug Discov. Today. (1998), 3, 160.
  • Venkatesh, S.; Lipper, R. A. J. Pharm. Sci. (2000), 89, 145.
  • Hann, M.; Green, R. Curr. Opin. Chem. Biol. (1999), 3, 379.
  • Chapman y Hall. The Merck Index. Twelfth Edition. (1996).
  • Negwer, M. Organic-chemical Drugs and their synonyms. Ed. Akademie-verlag, (1987).
  • Goodman, A. G.; Goodman, L. S.; Gilman, A. Las Bases Farmacológicas de la Terapéutica. McGraw-Hill interam. 9na Ed. Vol II, (1996).
Fuente de los datos: Dialnet