Epidemiología de la infección por rotavirus en Gipuzkoa (1995-2015). Carga de la enfermedad y genotipos circulantes

Resumen

Rotavirus (RV) es la causa principal de la gastroenteritis aguda (GEA) infantil grave a nivel mundial. Los objetivos principales de esta Tesis fueron conocer las características epidemiológicas de la infección por RV, su impacto y los genotipos circulantes en la población de Gipuzkoa entre 1995 y 2015. RV fue responsable del 10,5% de los cuadros de GEA ocurridos en < 5 años, 30% en el período invernal. En el último quinquenio del estudio se observó un retraso en el comienzo de las epidemias así como un acortamiento en su duración. El impacto de la infección en el Sistema Sanitario fue importante: la incidencia media anual de GEA por RV confirmada virológicamente en los < 5 años de edad fue superior a 1000 casos/100.000 niños; Además, RV fue la primera causa de hospitalización debida a GEA en este grupo de edad, superando la incidencia media de hospitalización los 100 casos/100.000 niños y año, tasa que fue cuatro veces mayor en los de 6 a 12 meses.Entre las más de 3000 cepas genotipadas, G1P[8] fue el genotipo más frecuente seguido por los genotipos emergentes G9P[8] y G12P[8]. G1P[8] fue detectado todas las temporadas excepto una, circulando los restantes genotipos de modo más intermitente. Sin embargo, en el periodo 2010-2015, RV G12 fue el más frecuente, representando el 35% de los casos, siendo dominante en las temporadas 2010-2011, 2011-2012 y codominante en 2014-2015. El análisis del genoma completo mostró escasa diversidad genética entre las cepas G12P[8] causantes de cada brote epidémico pero importantes diferencias entre las cepas de uno y otro brote, sugiriendo que las cepas epidémicas fueron fruto de introducciones anuales. Sólo un 1,2% de las cepas genotipadas pertenecieron a G-tipos inusuales. Entre ellas destacó una cepa G3P[8] atípica con gen VP7 de origen equino y paradójicamente constelación genética tipo DS-1 que circuló en Gipuzkoa en la primavera de 2015, ocasionando más de 65 casos de GEA. Los estudios filogenéticos sugirieron que esta cepa fue generada recientemente en Asia o Australia. También fueron detectadas cepas con el P-tipo P[14], típico de mamíferos artiodáctilos, asociado a G6, G8 o G10.