Prediction of ADME properties. Part 1, Classification models to predit Caco-2 cell permeability using atom-based bilinear indices

  1. Castillo Garit, Juan A.
  2. Cañizares Carmenate, Yudith
  3. Marrero Ponce, Yiovani
  4. Torrens Zaragozá, Francisco
  5. Abad Mazarío, Concepción
Revista:
Afinidad: Revista de química teórica y aplicada

ISSN: 0001-9704

Año de publicación: 2014

Volumen: 71

Número: 566

Páginas: 129-138

Tipo: Artículo

Otras publicaciones en: Afinidad: Revista de química teórica y aplicada

Resumen

Se lleva a cabo la predicción de la permeabilidad a través de células cultivadas de Caco-2 (de uso frecuente en el modelo in vitro para la absorción de fármacos), usando modelos teóricos. Se utilizan índices atómicos bilineales y análisis discriminante lineal (LOA) para obtener modelos cuantitativos, que discriminan entre compuestos con una elevada absorción y compuestos con absorción baja o moderada, que forman una base de datos de medida P caco-2 a partir de un gran conjunto de 157 compuestos estructuralmente diversos. Desarrollamos dos modelos LOA, con más de un 90% de exactitud para los conjuntos de prueba y de ensayo; el mejor modelo presenta una precisión de 91 ,79 % y 91 ,30 %, respectivamente. Los resultados obtenidos en este trabajo se comparan favorablemente con otros métodos publicados anteriormente en la literatura técn ica. El porcentaje de buena correlación fue del 80% en el cribado virtual de 241 fármacos con los valores reportados del porcentaje de absorción intestinal humana ( EIS ). Por último, podemos decir que en el presente "in silico" método podría ser una herramienta valiosa en el proceso de descubrimiento de fármacos con el fin de seleccionar las moléculas con las mayores posibilidades antes de la síntesis.