Evolución molecular y relacioes taxonómicas de la familia bromoviridae de virus de plantas

Zusammenfassung

La Informática se ha convertido en una herramienta importante en los estudios evolutivos durante los últimos 25 ai\os. El aumento en el uso de la programación y el desarrollo de nuevos algoritmos dentro de esta y otras áreas de la biología ha lIevado a la generación de una nueva disciplina científica lIamada Bioinformática. A pesar de su corta vida como ciencia, millones y millones de programas se han desarrollado y se han puesto a disposición de los investigadores, no solo centrados para el desarrollo de estudios dentro del campo de la Evolución Molecular, sino además se han desarrollado programas para solucionar problemas de tiempo consumido en la clasificación y ordenación de organismos, secuancias y estructuras; en la predicción de estructuras; en el modelado; en las simulaciones, etc... En esta tesis se ha nevado a cabo un estudio de la Evolución Molecular de la familia de virus de plantas Bromoviridae. La familia Bromoviridae es una de las familias mas importantes de virus de plantas debido a que sus miembros afectan a un amplio rango de hospedadores y la causa de daños serios en la aglicultura, afectando no sólo a árboles frutales, sino además a muchos tipos de cultivos como es el caso del pepino, alfalfa, judias, etc. El genoma de Ios miembros de la familia Bromoviridae es de aproximadamente 8 Kb de largo, organizado en tres RNA's de simple cadena de polaridad positiva. Los RNA-1 y RNA-2 codifican una sola ORF (proteinas P1 y P2) que estan implicadas en la replicacion del virus. En los géneros de Ilarvirus y Cucumovirus el RNA2 codifica una segunda ORF, la proteína P2b, la cual es aparentemente traducida por un RNA subgenómico (sgRNA), y que esta implicada en la supresión del silenciamiento génico, en la virulencia del virus y en el movimiento sistémico del mismo a través de la planta. El RNA-3 es bicistrónico y posee dos ORF's que codifican para las proteínas de movimiento (MP) y la proteina de cubier