Estudio estructural y diseño de peptidos bioactivos

Resumen

Los estudios iniciales de CD y el analisis de los espectros obtenidos de experimentos de RMN utilizando DMSO como disolventes indicaban que los peptidos de secuencia Ac-L WRIL W-NH2 y Ac-1wrilw-NH2 poseian cierta tendencia a formar helices alfa. En el primer caso helices alfa a derechas y en el segundo hélices alfa a izquierdas. Los dos hexapeptidos resultaron activos e la inhibicion de calmoldulina. Los estudios de busqueda conformacional realizados siempre llevaron a helices alfa como las estructuras mas estables para estos hexapeptidos. En disolucion acuosa se observa un aumento de la poblacion de conformaciones en helice alfa. Los espectros de CD, los desplazamientos quimicos, constantes de acoplamiento y NOEs de medio alcance, indican que en presencia de un 30% de TFE la estructura en helice alfa es predominante. Los datos de RMN se utilizaron como restricciones para generar, utilizando la tecnica de templado simulando, una familia de estructuras. El analisis de posibles interacciones intramoleculares en esta familia de estructuras muestra que son posibles numerosos puestes de hidrogeno con las cadenas laterales y grupos de "capping". Asi mismo, las cadenas laterales de los residuos hidrofobos(leucinas e isoleucina) se encuentran proximas formando un pequeño nucleo hidrofobo. Las cadenas laterales de los triptófanos pueden interaccionar con las zonas hidrofóbicas o con el grupo amino cargado de la cadena lateral de la arginina (interaccion del tipo cation-orbital r), aunque no se ha encontrado una evidencia experimental clara al respecto. Tambien se han contrastado los determinantes de la estabilizacion estructural estudiando una familia de analogos con algunas sustituciones en los residuos originales. Todos ellos fueron estudiados por RMN y CD. Entre ellos es de destacar el importante papel de acetilo N-terminal como "iniciador" de la helice. Su eliminacion comportaba la perdida de cualquier indicio de estructura. Todas las su