Caracterització molecular i anàlisi de la dinàmica poblacional de recuperació d'eficàcia del virus de estomatitis vesicular
- BRACHO LAPIEDRA, LAPIEDRA M. ALMA
- Andrés Moya Simarro Director
- Eladio Barrio Esparducer Co-director
Defence university: Universitat de València
Fecha de defensa: 29 July 2003
- Manuel Serra Chair
- Fernando González Candelas Secretary
- Ricardo Flores Pedauye Committee member
- Santiago F. Elena Committee member
- Josep Quer Sivila Committee member
Type: Thesis
Abstract
La evolución molecular viral es una disciplina heredera de la evolución molecular y la virología. La evolución experimental invierte ciertos términos de la investigación en genética de poblaciones y evolución porque permite controlar parámetros como el tamaño poblacional o los coeficientes de selección. Las poblaciones virales se encuentran sometidas al balance de las fuerzas evolutivas que son la mutación, la selección, la deriva y la migración. El trinquete de Muller es un modelo de deriva continuada que ocurre en poblaciones asexuales y pequeñas con resultado de disminución de la eficacia biológica y probable extinción de la población. Una de las premisas necesaria para que se cumpla este modelo es la irreversabilidad de las mutaciones. La caracterización molecular parcial, mediante RP-PCR y secuenciación de una población del virus de la estomatitis vesicular (VSV) debilitada por efecto del trinquete de Muller, demuestra que la mutación más probable responsable de la disminución de la eficacia es una acumulación de inserciones y deleciones en una zona reguladora de la transcripción. Esta población debilita se sometió a expansión poblacional y recuperó rápidamente eficacia hasta un valor cercano al anterior a la aplicación de los cuellos de botella poblacionales. La retromutación en esta zona reguladora es probablemente responsable de la recuperación de eficacia. Este resultado compromete una de las premisas del trinquete de Muller que es la pérdida de la clase de genomas no mutados, ya que la retromutación puede operar en poblaciones de ribovirus. Por otra parte, bajos niveles de polimorfismo molecular pueden ser explicado satisfactoriamente por arrastre genético asociado a fenómenos de selección estabilizante y selección purificadora. Finalmente las estimas de tamaño poblacional efectivo de las poblaciones de virus de RNA resultaron muy inferiores al tamaño poblacional estimado por recuento de v